Mendix не генерирует исходный код, кроме стандартного исходного кода для пользовательских действий Java. Созданная вами модель интерпретируется во время выполнения.
Полное раскрытие: я сотрудник Mendix, но то, что я публикую здесь, является личным, а не официальным заявлением.