Чтение данных из необработанного файла VTK (.vtu) - PullRequest
Новая
       12

Чтение данных из необработанного файла VTK (.vtu)

0 голосов
/ 04 января 2019

Я хочу извлечь массивы данных из файла .vtu с помощью модуля Python VTK. Файл выглядит следующим образом (необработанные данные в конце файла опущены): 

<?xml version="1.0"?>
<VTKFile type="UnstructuredGrid" version="0.1" byte_order="LittleEndian">
  <UnstructuredGrid>
    <Piece NumberOfPoints="10471" NumberOfCells="64892">
      <PointData>
        <DataArray type="Float64" Name="potential" NumberOfComponents="1" format="appended" offset="0"/>
        <DataArray type="Float64" Name="electric field" NumberOfComponents="3" format="appended" offset="83772"/>
      </PointData>
      <CellData>
        <DataArray type="Int32" Name="GeometryIds" format="appended" offset="335080"/>
      </CellData>
      <Points>
        <DataArray type="Float64" NumberOfComponents="3" format="appended" offset="594652"/>
      </Points>
      <Cells>
        <DataArray type="Int32" Name="connectivity" format="appended" offset="845960"/>
        <DataArray type="Int32" Name="offsets" format="appended" offset="1865068"/>
        <DataArray type="Int32" Name="types" format="appended" offset="2124640"/>
      </Cells>
    </Piece>
  </UnstructuredGrid>
<AppendedData encoding="raw">

Я пытаюсь извлечь данные, используя следующий код Python: 

import numpy
from vtk import vtkUnstructuredGridReader
from vtk.util import numpy_support as VN

reader = vtkUnstructuredGridReader()
reader.SetFileName("charged_wire.vtu")
reader.ReadAllVectorsOn()
reader.ReadAllScalarsOn()
reader.Update()

data = reader.GetOutput()
potential = data.GetPointData().GetScalars("potential")

print(type(potential))

К сожалению, эта программа печатает NoneType как вывод, и я не совсем уверен, что мне нужно изменить, чтобы извлечь хранилища данных в массиве potential?

1 Ответ

0 голосов
/ 07 января 2019

Вы не используете правильный читатель, это файл .vtu, вы должны использовать vtkXMLUnstructuredGridReader. 

import vtk.vtk

# The source file
file_name = "path/to/your/file.vtu"

# Read the source file.
reader = vtk.vtkXMLUnstructuredGridReader()
reader.SetFileName(file_name)
reader.Update()  # Needed because of GetScalarRange
output = reader.GetOutput()
potential = output.GetPointData().GetArray("potential")
...