ОШИБКА: неудачная загрузка для пакета «BiocGenerics» - PullRequest
0 голосов
/ 27 апреля 2018

Я пытаюсь установить этот пакет "BiocGenerics" в R и получаю эту ошибку.

BioC_mirror: https://bioconductor.org Использование Bioconductor 3.6 (BiocInstaller 1.28.0), R 3.4.2 (2017-09-28). Установка пакета (ов) "BiocGenerics" пытается URL «https://bioconductor.org/packages/3.6/bioc/src/contrib/BiocGenerics_0.24.0.tar.gz' Тип контента 'application / x-gzip', длина 43393 байта (42 КБ) ================================================== скачано 42 КБ

  • установка source пакета "BiocGenerics" ... ** Р ** инст ** подготовка пакета для отложенной загрузки. Создание новой универсальной функции для «добавления» в пакете «BiocGenerics». Создание новой универсальной функции. для «as.data.frame» в пакете «BiocGenerics» Создание нового универсального функция для «cbind» в пакете «BiocGenerics» Ошибка: идентичен (as.call (parse (text = old_code) [[1L]]), тело [[7L]] [[3L]]) не истинная ошибка в apply_hotfix73465 (getGeneric ("cbind")): исправление не удалось выполнить для универсальной функции cbind () Ошибка: невозможно загрузить код R в ОШИБКА пакета "BiocGenerics": отложенная загрузка для пакета «BiocGenerics»
  • удаление ‘/home/hamna/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/BiocGenerics’

Загруженные исходные пакеты находятся в Путь установки ‘/ tmp / RtmprEuKCy / download_packages 'отсутствует записываемый, не может обновлять пакеты: BiocGenerics, littler, cluster, иностранный, МАССА, Матрица, MGCV, NLME, Rpart, выживание Предупреждающее сообщение: В install.packages (pkgs = do, lib = lib, ...): установка пакет «BiocGenerics» имел ненулевой статус выхода

Я пытался установить его вручную, но он не работает. И тогда я попробовал эту команду на терминале

sudo apt-get install r-bioc-biocgenerics

Это помогло мне, но он установил более старую версию, которая не подходит для моего окончательного пакета "hgu133plus2.db"

Пожалуйста, помогите! Лучшее,

1 Ответ

0 голосов
/ 27 апреля 2018

На этот вопрос ответили на сайте поддержки Bioconductor.

Существует проблема с версией R 3.4.2, которая требует исправления. Лучшее решение - обновить до версии не ниже 3.4.3.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...