Предполагая, что вы имеете в виду, что CSS находится в элементе head вашего HTML, а не в вашем файле CSS, с какой проблемой вы удалили CSS из элемента head и поместили его в таблицу стилей?
Например, вместо:
<head>
<style type="text/css">
hr {color:sienna}
p {margin-left:20px}
body {background-image:url("images/back40.gif")}
</style>
</head>
Поместите эти три строки в свой CSS:
hr {color:sienna}
p {margin-left:20px}
body {background-image:url("images/back40.gif")}
Для получения дополнительной информации см. CSS в W3School .
Если вы можете изменить только таблицу стилей, попробуйте использовать !important, чтобы переопределить стили, определенные в элементе head:
p { margin-left: 50px !important; }