Попробуйте выполнить следующие действия.
1. Запустите pycharm.exe или pycharm64.exe из командной строки Anaconda
Откройте приглашение Anaconda и просто вставьте полный путь к pycharm.exe и подтвердите ввод нажатием Enter.
В качестве альтернативы, создайте файл "PyCharm.bat", вставьте и настройте следующий код:
set CondaDir="C:\ProgramData\Anaconda3"
set PyCharm="C:\Program Files\JetBrains\PyCharm 2018.3.2\bin\pycharm64.exe"
call %CondaDir:"=%\Scripts\activate.bat
%PyCharm%
2. Убедитесь, что интерпретатор Python установлен правильно
Перейдите в меню Файл> Настройки> Проект: ...> Интерпретатор проекта. Затем нажмите на значок шестеренки и покажите все ... Здесь вы можете установить виртуальную среду или системный интерпретатор.
3. Проверьте рабочий каталог
Перейдите в меню Файл> Настройки> Построение, Выполнение, Развертывание> Консоль> Консоль Python> Рабочий каталог. Убедитесь, что рабочий каталог существует и у вас есть права на чтение / запись.
4. Обновление пакетов и анаконды
Обновить все пакеты с помощью conda update --all
Обновите conda с conda update conda
5. Переустановите Anaconda и Pycharm
Сделайте это, если больше ничего не поможет.