1) Да, это должно работать. Как и в случае с новыми шаблонами CorDapp, потоки не зависят от CorDapp, содержащего состояния и контракты.
2) Да, это не должно быть проблемой. Новые состояния будут другого типа.
3) Не сейчас, белый список только для добавления. Это может измениться с ограничениями подписи, которые находятся в работах.
4) Это полностью ваше дело - NodeB по-прежнему будет иметь V1 в своем пути к классам и сможет продолжать создавать состояния V1.