Вы можете использовать javascript, чтобы отключить «родительские» флажки, прежде чем они будут опубликованы на сервере.
Добавьте класс к своим родительским флажкам, чтобы сделать простой селектор jquery:
<input type="checkbox" class="parent" />
Затем некоторые JavaScript, чтобы отключить флажки:
$(".parent").prop("disabled",true);