Я получаю загадочную ошибку от ggfortify::autoplot() при попытке использования любых функций из пакета cluster.
# load the environment
install.packages("ggplot2"); library(ggplot2)
install.packages("ggfortify"); library(ggfortify)
install.packages("cluster"); library(cluster)
Используйте пример из виньетки [Tag: ggfortify] для cluster::pam:
autoplot(cluster::pam(iris[-5], 3), frame = TRUE, frame.type = 'norm')
Ошибка: (преобразовано из предупреждения) частичное совпадение «кластера» с «кластеризацией»
Я знаю, что иногда ошибки могут быть вызваны конфликтами между пакетами, то есть два (или более) пакета могут иметь функции, названные одинаково. Тем не менее, я не думаю, что это проблема, так как я адаптировал код из виньетки, чтобы конкретно указать, из какого пакета я хотел получить функцию с cluster::pam, и я не вижу проблем с conflicts(detail=TRUE).
sessionInfo()
R версия 3.5.2 (2018-12-20) Платформа: x86_64-w64-mingw32 / x64 (64-разрядная версия) Работает под: Windows> = 8 x64 (сборка
9200)
Матричные продукты: по умолчанию
языковой стандарт: 1 LC_COLLATE = English_Canada.1252 [2]
LC_CTYPE = English_Canada.1252 [3] LC_MONETARY = English_Canada.1252
[4] LC_NUMERIC = C [5] LC_TIME = English_Canada.1252
прикрепленные базовые пакеты: 1 stats graphics grDevices [4] utils
методы наборов данных [7] база
другие прикрепленные пакеты: 1 ggfortify_0.4.5 [2] ggplot2_3.1.0
[3] cluster_2.0.7-1 [4] usethis_1.4.0.9000 [5] devtools_2.0.1
загружено через пространство имен (и не подключено): 1 Rcpp_1.0.0 [2]
compiler_3.5.2 [3] pillar_1.3.1 [4] plyr_1.8.4 [5]
bindr_0.1.1 [6] prettyunits_1.0.2 [7] remotes_2.0.2 [8]
tools_3.5.2 [9] testthat_2.0.1 [10] digest_0.6.18 [11]
pkgbuild_1.0.2 [12] pkgload_1.0.2 [13] memoise_1.1.0 [14]
tibble_1.4.2 [15] gtable_0.2.0 [16] pkgconfig_2.0.2 [17]
rlang_0.3.0.1 [18] cli_1.0.1 [19] rstudioapi_0.8 [20]
yaml_2.2.0 [21] bindrcpp_0.2.2 [22] gridExtra_2.3 [23]
stringr_1.3.1 [24] withr_2.1.2 [25] dplyr_0.7.8 [26]
desc_1.2.0 [27] fs_1.2.6 [28] tidyselect_0.2.5 [29]
rprojroot_1.3-2 [30] grid_3.5.2 [31] glue_1.3.0 [32]
R6_2.3.0 [33] processx_3.2.1 [34] sessioninfo_1.1.1 [35]
tidyr_0.8.2 [36] purrr_0.2.5 [37] callr_3.1.1 [38]
magrittr_1.5 [39] backports_1.1.3 [40] scale_1.0.0 [41]
ps_1.3.0 [42] assertthat_0.2.0 [43] colorspace_1.3-2 [44]
stringi_1.2.4 [45] lazyeval_0.2.1 [46] munsell_0.5.0 [47]
crayon_1.3.4