Это, скорее всего, проблема с вашей установкой VirtualBox, а не с Vagrant. Чтобы подтвердить это, вы должны получить ту же ошибку при запуске: VBoxManage list vms
Распространенная причина этой ошибки: /tmp
заполнен или имеет неправильные разрешения.
Чтобы проверить, заполнен ли /tmp
, попробуйте df -h
Чтобы исправить разрешения на /tmp
, если они неверны, попробуйте sudo chmod ug-s /tmp && sudo rm -rf /tmp/.vbox*