Синтаксическая ошибка в awk - PullRequest
Новая
       13

Синтаксическая ошибка в awk

0 голосов
/ 27 апреля 2018

Я пишу небольшую программу, функциональность которой похожа на следующую. Он использует файл с именем hist1.dat и первый шаг выглядит так: 

awk '{if(NR>1) s+=$2*($1-x); x=$1}END{print s}' hist1.dat >int1.txt

Hist1.dat похож на следующий 

0.259990113102 4
0.261752339307 10
0.263514565512 15
0.265276791717 35
0.267039017922 58
0.268801244127 84
0.270563470333 147
0.272325696537 217
0.274087922742 316
0.275850148947 410
0.277612375152 583
0.279374601357 750
0.281136827562 881
0.282899053767 1004
0.284661279972 1241

int1.txt содержит значение 79.9504. Второй шаг использует это значение и обрабатывает его следующим образом 

awk '{if(NR>1) s+=$2*($1-x); print $1,s/c1; x=$1}' c1="$(cat int1.txt)" hist1.dat >cutoff1_org.txt

cutoff1_org.txt выглядит следующим образом 

0.321668030277 0.832661
0.323430256483 0.851265
0.325192482688 0.867267
0.326954708893 0.882167
0.328716935097 0.895634
0.330479161302 0.906677
0.332241387507 0.917587
0.334003613712 0.927175
0.335765839917 0.935287
0.337528066122 0.9432
0.339290292327 0.94968
0.341052518532 0.955675
0.342814744737 0.961097
0.344576970942 0.96555
0.346339197147 0.969231

Следующий скрипт использует файл cutoff1_org.txt и пытается найти значение в столбце 1, если соответствующее значение в столбце 2 близко к 0,95. Это тоже хорошо работает 

awk -v c=2 -v t=0.95 'NR==1{d=$c-t;d=d<0?-d:d;v=$c;next}{m=$c-t;m=m<0?-m:m}m<d{d=m;v=$1}END{print v}' cutoff1_org.txt >final_cutoff1.txt

Следующие два сценария будут просто использовать значения из final_cutoff1.txt. Что-то вроде следующего 

awk '{ if ($1 >= cutoff1) print $1 }' cutoff1="$(cat final_cutoff1.txt)" hist1.dat >hist_oc1.dat                                                                                                         
awk '{ if ($1 <= cutoff1) print $1 }' cutoff1="$(cat final_cutoff1.txt)" hist1.dat >hist_uc1.dat

Теперь я хочу поместить в цикл, как показано 

for i in {1..22}; do                                                                                                                                                                                                        
    awk '{if(NR>1) s+=$2*($1-x); x=$1}END{print s}' hist${i}.dat >int${i}.txt                                                                                                                                               
    awk '{if(NR>1) s+=$2*($1-x); print $1,s/c${i}; x=$1}' c${i}="$(cat int${i}.txt)" hist${i}.dat >cutoff${i}_org.txt                                                                                                       
    awk -v c=2 -v t=0.95 'NR==1{d=$c-t;d=d<0?-d:d;v=$c;next}{m=$c-t;m=m<0?-m:m}m<d{d=m;v=$1}END{print v}' cutoff${i}_org.txt >final_cutoff${i}.txt                                                                          
    awk '{ if ($1 >= cutoff${i}) print $1 }' cutoff${i}="$(cat final_cutoff${i}.txt)" hist${i}.dat >hist_oc${i}.dat                                                                                                         
    awk '{ if ($1 <= cutoff${i}) print $1 }' cutoff${i}="$(cat final_cutoff${i}.txt)" hist${i}.dat >hist_uc${i}.dat                                                                                                         
    cat hist_oc${i}.dat |stdev >stat_oc${i}.txt                                                                                                                                                                             
    cat hist_uc${i}.dat |stdev >stat_uc${i}.txt                                                                                                                                                                             
done

Однако я получил ошибку вроде 

awk: cmd. line:1: {if(NR>1) s+=$2*($1-x); print $1,s/c${i}; x=$1}
awk: cmd. line:1:                                      ^ syntax error
awk: cmd. line:1: {if(NR>1) s+=$2*($1-x); print $1,s/c${i}; x=$1}
awk: cmd. line:1:                                               ^ syntax error
awk: cmd. line:1: { if ($1 >= cutoff${i}) print $1 }
awk: cmd. line:1:                    ^ syntax error

Я думаю, что у меня теперь мозг исчезает. Похоже, очень легко исправить ошибку. Может кто-нибудь, пожалуйста, укажите и помогите с этим. Большое спасибо заранее

...