Если я вас правильно понимаю, вас интересуют абсолютные пути к параметрам вашего скрипта. Таким образом, вы можете использовать realpath
.
Сценарий вызова:
test.sh $(realpath para1) $(realpath para2)
Или в вашем сценарии:
java -jar target/test-SNAPSHOT.jar "$(realpath "$1")" "$(realpath "$2")"
Обсуждаются еще несколько альтернатив здесь .