Вы можете скрыть верхний и нижний колонтитулы, передав параметр cookie в вашем запросе. Таким образом, на стороне сервера на основе cookie будут видны верхний и нижний колонтитулы, или вы можете применить код Javascript, чтобы отключить его через JavaScript, вы можете использовать этот код в didFinish Delegate
public func webView(_ webView: WKWebView, didFinish navigation: WKNavigation!) {
self.wkwebView.evaluateJavaScript("document.getElementById(\"header\").style.display='none';") { (result, error) in
if error == nil {
// header is hide now
}
}