1) Вам не нужно будет настраивать каждую систему с помощью SYSTEM или USER ODBC DSN для доступа к нужному MDB. Вы по-прежнему можете предоставить всю необходимую информацию в своем URL JDBC:
jdbc:odbc:Driver={Microsoft Access Driver (*.mdb)};DBQ=c:/yourdb.mdb
Но имейте в виду, что системе потребуется для установки драйвера, который вы используете.
2) Связь будет происходить так же, как и ваш драйвер ODBC. Если он открывает сокет для сервера (как происходит соединение Oracle ODBC), он открывает сокет. Если он использует вызовы библиотечных функций, он будет связываться через вызовы библиотечных функций.
Связь JDBC с ODBC использует JNI для связи.