Обновление базы R - Ubuntu с 3.4.4 до 3.5.2 - Azure - PullRequest
0 голосов
/ 07 января 2019

Я использую Ubuntu 16.04 на виртуальной машине Linux Azure

lsb_release -a
No LSB modules are available.
Distributor ID: Ubuntu
Description:    Ubuntu 16.04.5 LTS
Release:        16.04
Codename:       xenial

Текущая версия R для Rstudio / Rserver - 3.4.4, и я хотел бы обновить ее до последней версии (т.е. версии 3.5.2)

R --version
R version 3.4.4 (2018-03-15) -- "Someone to Lean On"
Copyright (C) 2018 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

По некоторым причинам, самый распространенный метод не работает:

apt-get update
apt-get upgrade

Итак, я провел некоторое исследование и нашел этот пост на biostars.org

В одном из постов говорится, что следующие коды могут работать

sudo su 
echo "deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu xenial-cran35/" >> /etc/apt/sources.list 
apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E084DAB9 
apt-get update 
apt-get install r-base 
apt-get install r-base-dev

Однако после apt-get install r-base я получаю следующее сообщение об ошибке:

root@VMforR:/usr/local/bin# apt-get install r-base
Reading package lists... Done
Building dependency tree
Reading state information... Done
Some packages could not be installed. This may mean that you have
requested an impossible situation or if you are using the unstable
distribution that some required packages have not yet been created
or been moved out of Incoming.
The following information may help to resolve the situation:

The following packages have unmet dependencies:
 r-base : Depends: r-recommended (= 3.5.2-1xenial) but it is not going to be installed
E: Unable to correct problems, you have held broken packages.

Я не понимаю, что означает "удерживаемые сломанные пакеты", и, что более важно, как обновить базу R?

Ответы [ 3 ]

0 голосов
/ 26 апреля 2019

Для меня сработало добавление PPA Майкла Раттера:

sudo add-apt-repository ppa:marutter/rrutter3.5
sudo apt-get update

Обновление R:

sudo apt install r-api-3.5

Я с Ubuntu 16.04 LTS.

0 голосов
/ 26 апреля 2019

После

apt-get update 

до

apt-get dist-upgrade

сначала «переместить установку вперед». Это включает в себя обновление уже установленных пакетов. Он должен просто обновить вашу установку R (если вы не переключаете / не нуждаетесь в переключении репозиториев).

Список r-sig-debian хорош и терпелив с базовыми принципами «как это сделать для X на R в Debian / Ubuntu». Рассмотрите возможность подписаться на скрытую информацию и / или задавать вопросы.

0 голосов
/ 07 января 2019

Пробовал некоторые другие методы, похоже, работает следующее:

sudo apt-get install r-base-core=3.5.2-1xenial

Ref: 1. Установить определенную версию (2.15.2) r-base на ubuntu 2. https://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu/xenial-cran35/

Но я не уверен, работает ли это также для других или нет, так как я не могу воспроизвести это.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...