R: дерево rpart растет с использованием двух объясняющих переменных, но не после удаления менее важной переменной - PullRequest
0 голосов
/ 28 апреля 2018

Данные: Я использую набор данных "истощение" из пакета rsample.

Вопрос: Используя набор данных истирания и библиотеку rpart, я могу вырастить дерево, используя формулу «Attrition ~ OverTime + JobRole», где OverTime выбрано в качестве первого разбиения. Но когда я пытаюсь вырастить дерево без переменной JobRole (то есть «Attrition ~ OverTime»), дерево не разделяется и возвращает только корневой узел. Это происходит как с помощью функции rpart, так и с помощью функции train карета с method = "rpart".

Я смущен этим, так как я думал, что алгоритм CART, реализованный в rpart, выбрал лучшую переменную для итеративного жадного разделения, и не "смотрел вперед", чтобы увидеть, как присутствие других переменных влияет на их выбор из лучшего раскола. Если алгоритм выбрал OverTime в качестве стоящего первого разделения в случае с двумя поясняющими переменными, почему он не выбрал OverTime в качестве стоящего первого разделения после удаления переменной JobRole?

Я использую R версии 3.4.2 и RStudio версии 1.1.442 с Windows 7.

Исследование: Я нашел похожие вопросы о переполнении стека здесь и здесь , но ни один из них не дал полных ответов.

Насколько я могу судить, rpart docs , похоже, на странице 5 говорит, что алгоритм rpart не использует правила "смотреть вперед":

Одним из способов решения обеих этих проблем является использование правил прогнозирования; но это вычислительно очень дорого. Вместо этого rpart использует одну из нескольких мер загрязненности, или Разнообразие, узла.

Также аналогичные описания здесь и здесь .

КОД: Вот пред. Любое понимание было бы здорово - спасибо!

suppressPackageStartupMessages(library(rsample))                                                                                                           
#> Warning: package 'rsample' was built under R version 3.4.4
suppressPackageStartupMessages(library(rpart))                                                                                                             
suppressPackageStartupMessages(library(caret))                                                                                                             
suppressPackageStartupMessages(library(dplyr))                                                                                                             
#> Warning: package 'dplyr' was built under R version 3.4.3
suppressPackageStartupMessages(library(purrr))                                                                                                             

#################################################                                                                                                          

# look at data                                                                                                                                             
data(attrition)                                                                                                                                            
attrition_subset <- attrition %>% select(Attrition, OverTime, JobRole)                                                                                     
attrition_subset %>% glimpse()                                                                                                                             
#> Observations: 1,470
#> Variables: 3
#> $ Attrition <fctr> Yes, No, Yes, No, No, No, No, No, No, No, No, No, N...
#> $ OverTime  <fctr> Yes, No, Yes, Yes, No, No, Yes, No, No, No, No, Yes...
#> $ JobRole   <fctr> Sales_Executive, Research_Scientist, Laboratory_Tec...
map_dfr(.x = attrition_subset, .f = ~ sum(is.na(.x)))                                                                                                      
#> # A tibble: 1 x 3
#>   Attrition OverTime JobRole
#>       <int>    <int>   <int>
#> 1         0        0       0

#################################################                                                                                                          

# with rpart                                                                                                                                               
attrition_rpart_w_JobRole <- rpart(Attrition ~ OverTime + JobRole, data = attrition_subset, method = "class", cp = .01)                                    
attrition_rpart_w_JobRole                                                                                                                                  
#> n= 1470 
#> 
#> node), split, n, loss, yval, (yprob)
#>       * denotes terminal node
#> 
#>  1) root 1470 237 No (0.83877551 0.16122449)  
#>    2) OverTime=No 1054 110 No (0.89563567 0.10436433) *
#>    3) OverTime=Yes 416 127 No (0.69471154 0.30528846)  
#>      6) JobRole=Healthcare_Representative,Manager,Manufacturing_Director,Research_Director 126  11 No (0.91269841 0.08730159) *
#>      7) JobRole=Human_Resources,Laboratory_Technician,Research_Scientist,Sales_Executive,Sales_Representative 290 116 No (0.60000000 0.40000000)  
#>       14) JobRole=Human_Resources,Research_Scientist,Sales_Executive 204  69 No (0.66176471 0.33823529) *
#>       15) JobRole=Laboratory_Technician,Sales_Representative 86  39 Yes (0.45348837 0.54651163) *

attrition_rpart_wo_JobRole <- rpart(Attrition ~ OverTime, data = attrition_subset, method = "class", cp = .01)                                             
attrition_rpart_wo_JobRole                                                                                                                                 
#> n= 1470 
#> 
#> node), split, n, loss, yval, (yprob)
#>       * denotes terminal node
#> 
#> 1) root 1470 237 No (0.8387755 0.1612245) *

#################################################                                                                                                          

# with caret                                                                                                                                               
attrition_caret_w_JobRole_non_dummies <- train(x = attrition_subset[ , -1], y = attrition_subset[ , 1], method = "rpart", tuneGrid = expand.grid(cp = .01))
attrition_caret_w_JobRole_non_dummies$finalModel                                                                                                           
#> n= 1470 
#> 
#> node), split, n, loss, yval, (yprob)
#>       * denotes terminal node
#> 
#>  1) root 1470 237 No (0.83877551 0.16122449)  
#>    2) OverTime=No 1054 110 No (0.89563567 0.10436433) *
#>    3) OverTime=Yes 416 127 No (0.69471154 0.30528846)  
#>      6) JobRole=Healthcare_Representative,Manager,Manufacturing_Director,Research_Director 126  11 No (0.91269841 0.08730159) *
#>      7) JobRole=Human_Resources,Laboratory_Technician,Research_Scientist,Sales_Executive,Sales_Representative 290 116 No (0.60000000 0.40000000)  
#>       14) JobRole=Human_Resources,Research_Scientist,Sales_Executive 204  69 No (0.66176471 0.33823529) *
#>       15) JobRole=Laboratory_Technician,Sales_Representative 86  39 Yes (0.45348837 0.54651163) *

attrition_caret_w_JobRole <- train(Attrition ~ OverTime + JobRole, data = attrition_subset, method = "rpart", tuneGrid = expand.grid(cp = .01))            
attrition_caret_w_JobRole$finalModel                                                                                                                       
#> n= 1470 
#> 
#> node), split, n, loss, yval, (yprob)
#>       * denotes terminal node
#> 
#> 1) root 1470 237 No (0.8387755 0.1612245)  
#>   2) OverTimeYes< 0.5 1054 110 No (0.8956357 0.1043643) *
#>   3) OverTimeYes>=0.5 416 127 No (0.6947115 0.3052885)  
#>     6) JobRoleSales_Representative< 0.5 392 111 No (0.7168367 0.2831633) *
#>     7) JobRoleSales_Representative>=0.5 24   8 Yes (0.3333333 0.6666667) *

attrition_caret_wo_JobRole <- train(Attrition ~ OverTime, data = attrition_subset, method = "rpart", tuneGrid = expand.grid(cp = .01))                     
attrition_caret_wo_JobRole$finalModel                                                                                                                      
#> n= 1470 
#> 
#> node), split, n, loss, yval, (yprob)
#>       * denotes terminal node
#> 
#> 1) root 1470 237 No (0.8387755 0.1612245) *

1 Ответ

0 голосов
/ 07 октября 2018

Это имеет смысл. У вас есть немного лишнего кода выше, поэтому я повторю основную часть.

library(rsample)
library(rpart)
data(attrition)

rpart(Attrition ~ OverTime + JobRole, data=attrition)
n= 1470 
node), split, n, loss, yval, (yprob)
      * denotes terminal node

 1) root 1470 237 No (0.83877551 0.16122449)  
   2) OverTime=No 1054 110 No (0.89563567 0.10436433) *
   3) OverTime=Yes 416 127 No (0.69471154 0.30528846)  
     6) JobRole=Healthcare_Representative,Manager,Manufacturing_Director,Research_Director 126  11 No (0.91269841 0.08730159) *
     7) JobRole=Human_Resources,Laboratory_Technician,Research_Scientist,Sales_Executive,Sales_Representative 290 116 No (0.60000000 0.40000000)  
      14) JobRole=Human_Resources,Research_Scientist,Sales_Executive 204  69 No (0.66176471 0.33823529) *
      15) JobRole=Laboratory_Technician,Sales_Representative 86  39 Yes (0.45348837 0.54651163) *

rpart(Attrition ~ OverTime, data=attrition)
n= 1470 
node), split, n, loss, yval, (yprob)
      * denotes terminal node

1) root 1470 237 No (0.8387755 0.1612245) *

Посмотрите на первую модель (с двумя переменными). Чуть ниже корня мы имеем:

1) root 1470 237 No (0.83877551 0.16122449)        
    2) OverTime=No 1054 110 No (0.89563567 0.10436433) *      
    3) OverTime=Yes 416 127 No (0.69471154 0.30528846)

Модель продолжает разделять узел 3 (OverTime = Yes), но только , используя JobRole. Поскольку у нас нет JobRole во второй модели, rpart не может сделать эти другие разбиения. Но обратите внимание, что в обоих узлах 2 и 3 Attrition = No является классом большинства. В узле 3 69,5% случаев - Нет, а 30,5% - Да. Таким образом, для обоих узлов 2 и 3 мы должны предсказать Нет. Поскольку предсказание одинаково с обеих сторон разделения, разделение не требуется и сокращается. Вам нужен только корневой узел, чтобы предсказать, что все экземпляры имеют номер.

...