Как выполнить порог? - PullRequest
Новая
       31

Как выполнить порог?

0 голосов
/ 28 июня 2018

Когда я применяю порог, я получаю сообщение об ошибке: 

import SimpleITK as sitk
img = sitk.ReadImage("Sub1.png")
img=img>20

Ошибка: 

RuntimeError                              Traceback (most recent call last)
<ipython-input-48-a1d4494dca15> in <module>()
      1 #img = sitk.Image(img.GetSize(), sitk.sitkUInt8)
----> 2 img=img>20

~/sitkpy/lib/python3.5/site-packages/SimpleITK/SimpleITK.py in __gt__(self, other)
   4424            return Greater( self, other )
   4425         try:
-> 4426            return Greater( self, float(other) )
   4427         except (ValueError, TypeError):
   4428            return NotImplemented

~/sitkpy/lib/python3.5/site-packages/SimpleITK/SimpleITK.py in Greater(*args)
  34345 
  34346     """
> 34347     return _SimpleITK.Greater(*args)
  34348 class GridImageSource(ImageFilter_0):
  34349     """

RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK Greater: /tmp/SimpleITK/Code/Common/include/sitkMemberFunctionFactory.hxx:209:
sitk::ERROR: Pixel type: vector of 8-bit unsigned integer is not supported in 2D byN3itk6simple18GreaterImageFilterE

Я применил img = sitk.Image(img.GetSize(), sitk.sitkUInt8), но получаю черное изображение.

Есть ли какая-либо опция, такая как double(img) или im2bw в Python? Нормализует работу? print (img) дает следующее

VectorImage (0x2f57af0) RTTI typeinfo: itk :: VectorImage Счетчик ссылок: 1 Изменено Время: 1289 Отладка: Выкл. Имя объекта: Наблюдатели: нет Источник: (нет) Имя выходного источника: (нет) Данные выпуска: Выкл. Дата выхода: Ложные Глобальные данные выпуска: Выкл. PipelineMTime: 1278 UpdateMTime: 1288 RealTimeStamp: 0 секунд LargestPossibleRegion: Размер: 2 Индекс: [0, 0] Размер: [305, 305] Буферизованный регион: Размер: 2 Индекс: [0, 0] Размер: [305, 305] Требуемый регион: Размер: 2 Индекс: [0, 0] Размер: [305, 305] Расстояние: [1, 1] Происхождение: [0, 0] Направление: 1 0 0 1

IndexToPointMatrix: 1 0 0 1

PointToIndexMatrix: 1 0 0 1

обратное направление: 1 0 0 1

VectorLength: 4 PixelContainer: ImportImageContainer (0x24ba950) RTTI typeinfo: itk :: ImportImageContainer Счетчик ссылок: 1 Модифицированное время: 1285 Отладка: выкл. Название объекта: Наблюдатели: никто Указатель: 0x30bb390 Контейнер управляет памятью: есть Размер: 372100 Вместимость: 372100

1024 *

1 Ответ

0 голосов
/ 28 июня 2018

Ваше исключение гласит: RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK Greater: /tmp/SimpleITK/Code/Common/include/sitkMemberFunctionFactory.hxx:209: sitk::ERROR: Pixel type: vector of 8-bit unsigned integer is not supported in 2D byN3itk6simple18GreaterImageFilterE

Попробуйте запустить: import SimpleITK as sitk img = sitk.ReadImage("Sub1.png") print img

Это означает, что ваше входное изображение НЕ является скалярным изображением, это изображение с несколькими компонентами. Символ «>» или sitk.GraterThan не поддерживает векторные изображения. Поддерживаются только скалярные изображения.

Вопрос в том, является ли ваше изображение изображением RGB? А как вы хотите бороться с «пороговым» многоканальным изображением?

...