изменить элемент вектора по имени в rcpp - PullRequest
0 голосов
/ 28 июня 2018

У меня есть функция, в которой мне нужно составить таблицу (tab, затем изменить одно значение - значение, где tab.names() == k, где k задается в вызове функции.

Глядя на http://dirk.eddelbuettel.com/code/rcpp/Rcpp-quickref.pdf, Я надеялся, что следующий код будет работать (замена "foo" именем переменной), но я предполагаю, что для имени элемента должно быть статическим, а мое имя не будет , Я пытался использовать which, но это не скомпилируется (недопустимое преобразование из 'char' в 'Rcpp :: traits :: storage_type <16> :: type {aka SEXPREC *}' - поэтому я делаю что-то не так есть.

#include <RcppArmadillo.h>
#include <algorithm>
//[[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::export]]
IntegerVector fun(const arma::vec& assignment, int k) {

  // count number of peptides per protein
  IntegerVector tab = table(as<IntegerVector>(wrap(assignment)));
  CharacterVector all_proteins = tab.names(); 

  char kc = '0' + k;

  // what I need a working version of: 
  tab(kc) = 1;  // gets ignored, as does a [] version of the same thing.
  // or
  tab('0' + k) = 1; // also ignored

  int ki = which(all_proteins == kc); // gives me compile errors

  // extra credit
  // tab.names(k-1) = "-1";

  return tab;
}

/*** R
set.seed(23)
  x <- rpois(20, 5)
  k <- 5

  fun(x, k)

  # same thing in R:
  expected_output <- table(x)
  expected_output # before modification
#  x
#   3  4  5  6  7  9 10 12 
#   2  4  3  3  4  2  1  1 

  expected_output[as.character(k)] <- 1 # this is what I need help with
  expected_output

#  x
#   3  4  5  6  7  9 10 12 
#   2  4  1  3  4  2  1  1 

  # extra credit:
  names(expected_output)[as.character(k)] <- -1

*/

Я все еще изучаю rcpp и, что более важно, все еще учусь читать страницы справочника и вставлять правильные условия поиска в google / stackoverflow. Я уверен, что это основные вещи (и я открыт для лучших методов - в настоящее время я думаю, как программист R с точки зрения начальных подходов к проблемам, а не программист C ++.)

(Кстати - использование arma::vec используется в других частях кода, которые я не показываю для простоты - я понимаю, что здесь это не полезно. Я обсуждал его переключение, но решил против этого по принципу, что Я протестировал эту часть, она работает, и последнее, что я хочу сделать, это добавить дополнительную ошибку ...)

Спасибо!

Ответы [ 2 ]

0 голосов
/ 28 июня 2018

Вы можете использовать метод .findName() для получения соответствующего index:

#include <RcppArmadillo.h>
#include <algorithm>
//[[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::export]]
IntegerVector fun(const arma::vec& assignment, int k) {

  // count number of peptides per protein
  IntegerVector tab = table(as<IntegerVector>(wrap(assignment)));
  CharacterVector all_proteins = tab.names(); 

  int index = tab.findName(std::string(1, '0' + k));

  tab(index) = 1;
  all_proteins(index) = "-1";
  tab.names() = all_proteins;

  return tab;
}

/*** R
set.seed(23)
x <- rpois(20, 5)
k <- 5

fun(x, k)
*/

Выход:

> Rcpp::sourceCpp('table-name.cpp')

> set.seed(23)

> x <- rpois(20, 5)

> k <- 5

> fun(x, k)
 3  4 -1  6  7  9 10 12 
 2  4  1  3  4  2  1  1 
0 голосов
/ 28 июня 2018

Вы можете написать свою собственную функцию (используйте String вместо char):

int first_which_equal(const CharacterVector& x, String y) {

  int n = x.size();
  for (int i = 0; i < n; i++) {
    if (x[i] == y) return(i);
  }

  return -1;
}

Также кажется, что tab(kc) преобразует kc в целочисленное представление.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...