1.) Используйте другой таймер («помощник»), который запускает предполагаемый таймер с первого такта, затем остановите этот таймер помощника.
2.) Cout тики вашего таймера и выполнять код обработчика событий только после того, как количество тиков превысило ограничение:
В этом примере код обработчика события запускается только после первых 100 тиков:
int tickCount;
public void Timer1_tick(...)
{
if( tickCount++ < 100 ) return;
// Do something...
}