Да (при условии, что я понимаю вопрос).
Если вы просто пытаетесь настроить значок Java в Dock, посмотрите ...
http://developer.apple.com/documentation/Java/Conceptual/Java14Development/03-JavaDeployment/JavaDeployment.html#//apple_ref/doc/uid/TP40001885-208447-TPXREF120
Точка два в разделе Комплекты приложений OSX
«Если вы добавите соответствующий значок, он показывает значок приложения в Dock, четко идентифицируя ваше приложение. (В противном случае в Dock появляется значок кофейной чашки Java по умолчанию.)»
Здесь также есть пример приложения (Java) для обработки событий перетаскивания для значка на панели:
http://www.devdaily.com/blog/post/jfc-swing/java-handle-drag-drop-events-mac-osx-dock-application-icon
Если вы хотите, чтобы ваше приложение автоматически добавляло свой значок во время установки на док-станцию (возможно, это то, что вы имеете в виду), вы должны знать, что не существует никакого «официального яблочного» способа сделать это, так как это BAD дизайн в OS X, чтобы заставить ваши иконки в доке пользователей, и, как правило, нахмурился. Все пользователи MAC, которых я знаю, будут немедленно удалять ваше приложение в результате такого поведения.
Тем не менее, вы можете просмотреть руководства по системному администрированию на сайте Apple, чтобы увидеть, как это можно сделать программно.