Рассчитать медиану для нескольких столбцов по группам на основе подмножеств, определенных другими столбцами - PullRequest
Новая
       38

Рассчитать медиану для нескольких столбцов по группам на основе подмножеств, определенных другими столбцами

0 голосов
/ 29 августа 2018

Я пытаюсь вычислить медиану (но ее можно заменить аналогичными показателями) по группам для нескольких столбцов на основе подмножеств, определенных другими столбцами. Это прямой вопрос из этого моего предыдущего поста . Я попытался включить вычисление медианы через aggregate в решение Map(function(x,y) dosomething, x, y), любезно предоставленное @Frank, но это не сработало. Позвольте мне проиллюстрировать:

Рассчитать медиану для A и B по группам GRP1 и GRP2 

df <- data.frame(GRP1 = c("A","A","A","A","A","A","B","B","B","B","B","B"), GRP2 = c("A","A","A","B","B","B","A","A","A","B","B","B"), A = c(0,4,6,7,0,1,9,0,0,8,3,4), B = c(6,0,4,8,6,7,0,9,9,7,3,0))

med <- aggregate(.~GRP1+GRP2,df,FUN=median)

Simple. Теперь добавьте столбцы, определяющие, какие строки будут использоваться для вычисления медианы, то есть строки с NA должны быть удалены, столбец a определяет, какие строки будут использоваться для вычисления медианы в столбце A, то же самое для столбцов b и B: 

a <- c(1,4,7,3,NA,3,7,NA,NA,4,8,1)
b <- c(5,NA,7,9,5,6,NA,8,1,7,2,9)
df1 <- cbind(df,a,b)

Как упоминалось выше, я пытался объединить Map и aggregate, но это не сработало. Я предполагаю, что Map не знает, что делать с GRP1 и GRP2. 

med1 <- Map(function(x,y) aggregate(.~GRP1+GRP2,df1[!is.na(y)],FUN=median), x=df1[,3:4], y=df1[, 5:6])

Вот результат, который я ищу: 

  GRP1 GRP2 A B
1    A    A 4 5
2    B    A 9 9
3    A    B 4 7
4    B    B 4 3

Любая помощь будет высоко ценится!

Ответы [ 2 ]

0 голосов
/ 29 августа 2018

С dplyr: 

library(dplyr)
df1 %>% 
  mutate(A = ifelse(is.na(a), NA, A),
         B = ifelse(is.na(b), NA, B)) %>% 
# I use this to put as NA the values we don't want to include
  group_by(GRP1, GRP2) %>% 
  summarise(A = median(A, na.rm = T),
            B = median(B, na.rm = T))

# A tibble: 4 x 4
# Groups:   GRP1 [?]
  GRP1  GRP2      A     B
  <fct> <fct> <dbl> <dbl>
1 A     A         4     5
2 A     B         4     7
3 B     A         9     9
4 B     B         4     3
0 голосов
/ 29 августа 2018

Использование data.table

library(data.table)
setDT(df1)

df1[, .(A = median(A[!is.na(a)]), B = median(B[!is.na(b)])), by = .(GRP1, GRP2)]

   GRP1 GRP2 A B
1:    A    A 4 5
2:    A    B 4 7
3:    B    A 9 9
4:    B    B 4 3

Та же логика в dplyr

library(dplyr)
df1 %>%
  group_by(GRP1, GRP2) %>%
  summarise(A = median(A[!is.na(a)]), B = median(B[!is.na(b)]))

Оригинал df1: 

df1 <- data.frame(
  GRP1 = c("A", "A", "A", "A", "A", "A", "B", "B", "B", "B", "B", "B"),
  GRP2 = c("A", "A", "A", "B", "B", "B", "A", "A", "A", "B", "B", "B"),
  A = c(0, 4, 6, 7, 0, 1, 9, 0, 0, 8, 3, 4),
  B = c(6, 0, 4, 8, 6, 7, 0, 9, 9, 7, 3, 0),
  a = c(1, 4, 7, 3, NA, 3, 7, NA, NA, 4, 8, 1),
  b = c(5, NA, 7, 9, 5, 6, NA, 8, 1, 7, 2, 9)
)
...