Файл .xcodeproj - это проект. Если у вас нет этого файла, у вас нет проекта. Остальные файлы - это просто файлы, которые принадлежат этому проекту, но как они принадлежат ему и какие роли они там играют, известно только самому проекту, и это файл .xcodeproj (который на самом деле не является файлом, это комплект, каталог, но в пользовательском интерфейсе он отображается так, как если бы он был одним файлом).