Как визуализировать изображение этикетки - PullRequest
Новая
       6

Как визуализировать изображение этикетки

0 голосов
/ 28 июня 2018

Я хочу сегментировать изображение. Я использовал простой метод определения порога. Для этого я читаю изображение и конвертирую его в массив, а затем конвертирую img 

import SimpleITK as sitk
import numpy as np
header = sitk.ReadImage("Sub1.png")
img = sitk.GetArrayFromImage(header)
a=img
img = ((img > 20) * 255).astype(np.uint8)
# To visualize the labels image in RGB with needs a image with 0-255 range
img_T1_255 = sitk.Cast(sitk.RescaleIntensity(a), sitk.sitkUInt8)
myshow(sitk.LabelOverlay(img_T1_255, img), "Basic Thresholding")

Ошибка: 

TypeError                                 Traceback (most recent call last)
<ipython-input-70-c44b80227919> in <module>()
      8 img = ((img > 20) * 255).astype(np.uint8)
      9 # To visualize the labels image in RGB with needs a image with 0-255 range
---> 10 img_T1_255 = sitk.Cast(sitk.RescaleIntensity(a), sitk.sitkUInt8)

~/sitkpy/lib/python3.5/site-packages/SimpleITK/SimpleITK.py in RescaleIntensity(image1, outputMinimum, outputMaximum)
  58734 
  58735     """
> 58736     return _SimpleITK.RescaleIntensity(image1, outputMinimum, outputMaximum)
  58737 class RichardsonLucyDeconvolutionImageFilter(ImageFilter_2):
  58738     """

TypeError: in method 'RescaleIntensity', argument 1 of type 'itk::simple::Image const &'

1 Ответ

0 голосов
/ 28 июня 2018

Вы преобразовали объект SimpleITK sitk.Image, 'header' (это имя переменной указывает на неправильное понимание того, что возвращает sitk.ReadImage), в массив nnd.array. Фильтры, функции и перегруженные операторы SimpleITK работают только с sitk.ImageTypes.

...