Можно ли читать содержимое двоичного файла как словарь в Python? - PullRequest
Новая
       10

Можно ли читать содержимое двоичного файла как словарь в Python?

0 голосов
/ 31 октября 2018

У меня есть файлы необработанных данных в двоичном формате. Хотя я написал код ранее в MATLAB, я хотел преобразовать его в PYTHON.

Я приложил пару двоичных файлов. Мой код MATLAB для чтения каждого из этих файлов на основе документа спецификации формата файла приведен ниже: 

f1 = fopen('p580.004','r')
if (f1 ~= -1)
    must = fread(f1,1,'int16');
    internaltrigger = fread(f1,1,'int8'); 
    internaldwell = fread(f1,1,'int8'); 
    dwellunits = fread(f1,1,'int8'); 
    check_dwell(dwellunits==0)=2;
    check_dwell(dwellunits==1)=0.002;
    check_dwell(dwellunits==2)=0.000002;
    check_dwell(dwellunits==3)=200;
    check_dwell(dwellunits>3)=NaN;
    check_dwell(dwellunits<0)=NaN;
    acqmode = fread(f1,1,'int8'); 
    formatdwell = fread(f1,1,'int32'); 
    passlength = fread(f1,1,'int16');
    passcount = fread(f1,1,'int32');
    passpreset = fread(f1,1,'int32');
    starttime = fread(f1,8,'*char');
    startdate = fread(f1,8,'*char');
    markerchannel = fread(f1,1,'int16');
    mcsno = fread(f1,1,'int8');
    calibtype = fread(f1,1,'int8');
    calibunit = fread(f1,4,'*char');
    calibcoef0 = fread(f1,4,'int8');
    calibcoef1 = fread(f1,4,'int8');
    externaldwelthrevolt = fread(f1,4,'int8');
    reserv1 = fread(f1,1,'int32');
    reserv2 = fread(f1,1,'int8');
    replacethesum = fread(f1,1,'int8');
    identbyte = fread(f1,1,'*char');
    progdwethrevolt = fread(f1,1,'int8');
    detdeslength = fread(f1,1,'int8');
    detdes = fread(f1,63,'*char');
    samplength = fread(f1,1,'int8');
    sampledes = fread(f1,63,'*char');
    lindisflag = fread(f1,1,'int8');
    linscale = fread(f1,1,'int8');
    disstarchannel = fread(f1,2,'int8');
    disnumchannels = fread(f1,1,'int16');
    reser = fread(f1,10,'int8');
    discse = fread(f1,1,'int8');
    discedg = fread(f1,1,'int8');
    discvolt = fread(f1,4,'int8');
    scaupvolt =fread(f1,1,'float32');
    scalolvolt = fread(f1,1,'float32');
    dwelltime = fread(f1,1,'float32');
    setconsflag = fread(f1,1,'int8');
    reserve = fread(f1,13,'int8');
    calibcoef2 = fread(f1,1,'float32');
    calibcoef3 = fread(f1,1,'float32');
    mcsid = fread(f1,8,'*char');
    if (dwelltime == check_dwell) && (length(startdate)>=2)
        x1= fread(f1,1024,'int32'); % Photon Count
        if (isempty(x1) ~= 1) && (length(x1) == 1024) && (length(find(x1>0))>100)
            photoncount(1:1024) = x1;
        else
            photoncount(1:1024) = NaN;
        end
        %%%%%%% converting char array to string %%%%%
        startdate=cell2mat(cellstr(startdate)');
        starttime=cell2mat(cellstr(starttime)');
        %%%%%%% checking for date format %%%%%
        test=find(startdate == '-');
        if (isempty(test) ~=1)
            day2=startdate(1,4:5);
            month2=startdate(1,1:2);
            year2=pfiles1(i).date(8:11);
        else
            if (strcmp(startdate,'') ~=1)
                day2=startdate(1,3:4);
                month2=startdate(1,1:2);
                year2=startdate(1,5:8);
            else
                day2='';
                month2='';
                year2='';
            end
        end
end

В PYTHON я написал следующий код: 

from array import array

fname = 'p580.004'

with open(fname,'rb') as file:

      pdata = array( 'B', file.read() )  # buffer the file

Вывод pdata приводит к следующему: 

pdata = 

Out[1]: array('B', [252, 255, 1, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 4, 212, 48, 0, 0, 212, 48, 0, 0, 48, 48, 58, 49, 52, 58, 51, 54, 48, 57, 50, 57, 50, 48, 49, 56, 75, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 11, 70, 179, 63, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 170, 1, 7, 77, 67, 66, 32, 49, 50, 49, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 225, 183, 15, 191, 255, 245, 31, 65, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 64, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 77, 67, 83, 112, 45, 48, 48, 49, 75, 0, 0, 0, 183, 0, 0, 0, 210, 0, 0, 0, 201, 0, 0, 0, 178, 0, 0, 0, 169, 0, 0, 0, 130, 0, 0, 0, 103, 0, 0, 0, 90, 0, 0, 0, 95, 0, 0, 0, 84, 0, 0, 0, 61, 0, 0, 0, 52, 0, 0, 0, 55, 0, 0, 0, 40, 0, 0, 0, 25, 0, 0, 0, 21, 0, 0, 0, 31, 0, 0, 0, 20, 0, 0, 0, 21, 0, 0, 0, 27, 0, 0, 0, 21, 0, 0, 0, 20, 0, 0, 0, 20, 0, 0, 0, 15, 0, 0, 0, 10, 0, 0, 0, 10, 0, 0, 0, 16, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 10, 0, 0, 0, 9, 0, 0, 0, 10, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 8, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 9, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 10, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 8, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 9, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 6, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0])

Если я использую следующий код Python: 

with open(fname,'rb') as f:  # b is important -> binary
    fileContent = f.read()

Теперь вывод fileContent дает вывод в шестнадцатеричном формате.

Ниже приведены мои запросы:

  1. Есть ли способ прочитать двоичный файл как словарь в Python?
  2. Как вы видите код MATLAB, есть разные отформатированные переменные, например, int8, int16, int32, char, float32. Как обрабатывать эти разные форматы с помощью кода Python, который я написал?
  3. Я пытался искать в Интернете, но не мог понять, как определить формат данных в двоичном файле (при условии, что у вас нет информации о спецификации формата) и как назначить фактические значения переменным.
  4. Может кто-нибудь помочь мне преобразовать скрипт MATLAB в код Python для чтения двоичного файла?

На основании предложений я изменил код, приведенный ниже: 

fname = 'p580.004'
with open(fname, 'rb') as fd:
    binbuf = fd.read()

data_names = ('must','internaltrigger','internaldwell','dwellunits', \
              'acqmode','formatdwell','passlength','passcount','passpreset', \
              'starttime','startdate','markerchannel','mcsno','calibtype', \
              'calibunit','calibcoef0','calibcoef1','externaldwelthrevolt', \
              'reserv1','reserv2','replacethesum','identbyte', \
              'progdwethrevolt','detdeslength','detdes','samplength', \
              'sampledes','lindisflag','linscale','disstarchannel', \
              'disnumchannels','reser','discse','discedg','discvolt', \
              'scaupvolt','scalolvolt','dwelltime','setconstflag', \
              'reserve','calibcoef2','calibcoef3','mcsid','Ncount')
data_tuple = struct.unpack_from('hbbbbihii8s8schbb4s4b4b4bibbcbb63pb63cbb2bh10bbb4bfffh13hff8c1024i', binbuf)

Основная проблема, с которой я сталкиваюсь, это определение формата двоичного файла. Существует несоответствие в len (binbuf) и struct.calcsize ('hbbbbihii8s8schbb4s4b4b4bibbcbb63pb63cbb2bh10bbb4bfffh13hff8c1024i'). Кто-нибудь может подсказать мне, где я ошибаюсь в форматировании на основе кода MATLAB, указанного выше?

Ответы [ 2 ]

0 голосов
/ 01 ноября 2018

Я мог бы написать код PYTHON, используя numpy, как показано ниже: 

import numpy as np

dt=np.dtype([('must',np.int16),
   ('nternaltrigger',np.int8),
   ('internaldwell',np.int8),
   ('dwellunits',np.int8),
   ('acqmode',np.int8),
   ('formatdwell',np.int32),
   ('passlength',np.int16),
   ('passcount',np.int32),
   ('passpreset',np.int32),
   ('starttime','|S8'),
   ('startdate','|S8'),
   ('markerchannel',np.int16),
   ('mcsno',np.int8),
   ('calibtype',np.int8),
   ('calibunit','|S4'),
   ('calibcoef0','|S4'),
   ('calibcoef1','|S4'),
   ('externaldwelthrevolt',np.int8,(4,)),
   ('reserv1',np.int32),
   ('reserv2',np.int8),
   ('replacethesum',np.int8),
   ('identbyte','|S1'),
   ('progdwethrevolt',np.int8),
   ('detdeslength',np.int8),
   ('detdes','|S63'),
   ('samplength',np.int8),
   ('sampledes','|S63'),
   ('lindisflag',np.int8),
   ('linscale',np.int8),
   ('disstarchannel',np.int8,(2,)),
   ('disnumchannels',np.int16),
   ('reser',np.int8,(10,)),
   ('discse',np.int8),
   ('discedg',np.int8),
   ('discvolt',np.int8,(4,)),
   ('scaupvolt',np.float32),
   ('scalolvolt',np.float32),
   ('dwelltime',np.float32),
   ('setconsflag',np.int8),
   ('reserve',np.int8,(13,)),
   ('calibcoef2',np.float32),
   ('calibcoef3',np.float32),
   ('mcsid','|S8'),
   ('photocount',np.int32,(1024,))])

f=np.fromfile('p580.004',dtype=dt)
d=dict(zip(f.dtype.names,f[0]))

Это работает нормально, как требуется. Спасибо всем за предложение и начальную помощь.

0 голосов
/ 31 октября 2018

Для чтения двоичных данных в переменную в python3 есть модуль struct. Он позволяет указать, как интерпретировать байты (например, unsigned long, char со знаком и т. Д.) И в каком порядке по строке формата.

например. Строка формата 'hbb' в вызове struct.unpack_from() в приведенных ниже примерах означает:

  • 'h': читать 16-разрядное целое число со знаком
  • 'b': затем 8-битный int
  • 'b': затем еще один 8-битный int

Быстрый пример для чтения первых 3 ваших переменных из двоичного файла: 

import struct

fname = 'p580.004'
with open(fname, 'rb') as fd:
    binbuf = fd.read()

must, internaltrigger, internaldwell = struct.unpack('hbb', binbuf)
print('must:', must)
print('internaltrigger:', internaltrigger)
print('internaldwell:', internaldwell)

Или, чтобы прочитать то же самое в словаре, как вы просили: 

import struct

fname = 'p580.004'
with open(fname, 'rb') as fd:
    binbuf = fd.read()

data_names = ('must', 'internaltrigger', 'internaldwell' )
data_tuple = struct.unpack('hbb', binbuf)
dictionary = dict(zip(data_names, data_tuple))
print(dictionary)

Подробнее об этом: https://docs.python.org/3/library/struct.html

...