Я пытаюсь добавить функцию iceemdan () в библиотеку с открытым исходным кодом libeemd.c. Я пытаюсь отладить его с помощью IDE. Первый вызов make-файла clang приводит к тому, что clang не может найти библиотеку gsl, даже если она присутствует и файл make, на котором основан файл make среды IDE, не имеет проблем со связью с gsl.
Вот вывод файла make (только ошибки gsl и контекст) с использованием файла make Codelite IDE:
Executing Pre Build commands ...
Done
make[1]: Leaving directory '/Users/Common/iceemdan-dev/iceemdan-dev/iceemdan-clang'
make[1]: Entering directory '/Users/Common/iceemdan-dev/iceemdan-dev/iceemdan-clang'
clang -o ./Debug/iceemdan-clang @"iceemdan-clang.txt" -L.
Undefined symbols for architecture x86_64:
"_gsl_linalg_solve_tridiag", referenced from:
_emd_evaluate_spline in main.c.o
"_gsl_poly_dd_eval", referenced from:
_emd_evaluate_spline in main.c.o
"_gsl_poly_dd_init", referenced from:
_emd_evaluate_spline in main.c.o
"_gsl_ran_gaussian", referenced from:
_iceemdan in main.c.o
_eemd in main.c.o
_ceemdan in main.c.o
"_gsl_rng_alloc", referenced from:
_allocate_eemd_workspace in main.c.o
"_gsl_rng_free", referenced from:
_free_eemd_workspace in main.c.o
"_gsl_rng_mt19937", referenced from:
_allocate_eemd_workspace in main.c.o
"_gsl_rng_set", referenced from:
_set_rng_seed in main.c.o
"_gsl_set_error_handler_off", referenced from:
_iceemdan in main.c.o
_eemd in main.c.o
_ceemdan in main.c.o
_emd_evaluate_spline in main.c.o
"_gsl_sf_sin", referenced from:
_main in main.c.o
"_gsl_stats_sd", referenced from:
_iceemdan in main.c.o
_eemd in main.c.o
_ceemdan in main.c.o
"_gsl_strerror", referenced from:
_emd_evaluate_spline in main.c.o
"_gsl_vector_view_array", referenced from:
_emd_evaluate_spline in main.c.o
ld: symbol(s) not found for architecture x86_64
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)
make[1]: *** [iceemdan-clang.mk:82: Debug/iceemdan-clang] Error 1
make[1]: Leaving directory '/Users/Common/iceemdan-dev/iceemdan-dev/iceemdan-clang'
make: *** [Makefile:5: All] Error 2
Этот make-файл, модификация файла make-пакета для запуска на Mac, работает:
.PHONY: all clean install uninstall
version := 1.4.1
gsl_flags := $(shell pkg-config --libs --cflags gsl)
ifeq ($(gsl_flags),)
$(error Failed to query GSL complilation flags from pkg-config)
endif
gsl_flags += -DHAVE_INLINE
commonflags := -Wall -Wextra -std=c99 -pedantic -Wno-unknown-pragmas -Wshadow -Wpointer-arith
commonflags += $(CFLAGS)
commonflags += -g -DEEMD_DEBUG=0
#commonflags += -fopenmp
commonflags += -DCLANG
PREFIX ?= /usr
SONAME = -soname
ifeq ($(shell uname -s),Darwin)
SONAME = -install_name
endif
define uninstall_msg
If you used $(PREFIX) as the prefix when running `make install`,
you can undo the install by removing these files:
$(PREFIX)/include/eemd.h
$(PREFIX)/lib/libeemd.a
$(PREFIX)/lib/libeemd.so
$(PREFIX)/lib/libeemd.so.$(version)
endef
export uninstall_msg
all: libeemd.so.$(version) libeemd.a eemd.h
clean:
rm -f libeemd.so libeemd.so.$(version) libeemd.a eemd.h obj/eemd.o
rm -rf obj
install:
install -d $(PREFIX)/include
install -d $(PREFIX)/lib
install -m644 eemd.h $(PREFIX)/include
install -m644 libeemd.a $(PREFIX)/lib
install libeemd.so.$(version) $(PREFIX)/lib
cp -Pf libeemd.so $(PREFIX)/lib
uninstall:
@echo "$$uninstall_msg"
obj:
mkdir -p obj
obj/eemd.o: src/eemd.c src/eemd.h | obj
clang $(commonflags) -c $< $(gsl_flags) -o $@
libeemd.a: obj/eemd.o
$(AR) rcs $@ $^
libeemd.so.$(version): src/eemd.c src/eemd.h
clang $(commonflags) $< -fPIC -shared -Wl,$(SONAME),$@ $(gsl_flags) -o $@
ln -sf $@ libeemd.so
eemd.h: src/eemd.h
cp $< $@
Файл создания второго уровня Codelite находится здесь. (Первый уровень просто вызывает его.) Я работаю в другом каталоге, чтобы избежать перезаписи моего хорошего кода.
##
## Auto Generated makefile by CodeLite IDE
## any manual changes will be erased
##
## Debug
ProjectName :=iceemdan-clang
ConfigurationName :=Debug
WorkspacePath :=/Users/Common/iceemdan-dev/iceemdan-dev
ProjectPath :=/Users/Common/iceemdan-dev/iceemdan-dev/iceemdan-clang
IntermediateDirectory :=./Debug
OutDir := $(IntermediateDirectory)
CurrentFileName :=
CurrentFilePath :=
CurrentFileFullPath :=
User :=Coleman Family
Date :=08/08/2018
CodeLitePath :="/Users/Common/Library/Application Support/CodeLite"
LinkerName :=clang
SharedObjectLinkerName :=clang -shared -fPIC
ObjectSuffix :=.o
DependSuffix :=
PreprocessSuffix :=.o.i
DebugSwitch :=-gstab
IncludeSwitch :=-I
LibrarySwitch :=-l
OutputSwitch :=-o
LibraryPathSwitch :=-L
PreprocessorSwitch :=-D
SourceSwitch :=-c
OutputFile :=$(IntermediateDirectory)/$(ProjectName)
Preprocessors :=
ObjectSwitch :=-o
ArchiveOutputSwitch :=
PreprocessOnlySwitch :=-E
ObjectsFileList :="iceemdan-clang.txt"
PCHCompileFlags :=
MakeDirCommand :=mkdir -p
LinkOptions :=
IncludePath := $(IncludeSwitch). $(IncludeSwitch).
IncludePCH :=
RcIncludePath :=
Libs :=
ArLibs :=
LibPath := $(LibraryPathSwitch).
##
## Common variables
## AR, CXX, CC, AS, CXXFLAGS and CFLAGS can be overriden using an environment variables
##
AR := ar rcus
CXX := clang++
CC := clang
CXXFLAGS := -g -O0 -Wall $(Preprocessors)
CFLAGS := $(commonflags) $< -fPIC -shared -Wl $@ $(gsl_flags) -o $@ $(Preprocessors)
ASFLAGS :=
AS := llvm-as
##
## User defined environment variables
##
CodeLiteDir:=/Applications/codelite.app/Contents/SharedSupport/
PATH:=/Users/Common/usr/local/bin:/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/bin:/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.5/bin:/opt/local/bin:/opt/local/sbin:/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/bin:/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin:/opt/X11/bin:/Library/TeX/texbin:/opt/local/include
Srcs=main.c
Objects0=$(IntermediateDirectory)/main.c$(ObjectSuffix)
Objects=$(Objects0)
##
## Main Build Targets
##
.PHONY: all clean PreBuild PrePreBuild PostBuild MakeIntermediateDirs
all: $(OutputFile)
$(OutputFile): $(IntermediateDirectory)/.d $(Objects)
@$(MakeDirCommand) $(@D)
@echo "" > $(IntermediateDirectory)/.d
@echo $(Objects0) > $(ObjectsFileList)
$(LinkerName) $(OutputSwitch)$(OutputFile) @$(ObjectsFileList) $(LibPath) $(Libs) $(LinkOptions)
MakeIntermediateDirs:
@test -d ./Debug || $(MakeDirCommand) ./Debug
$(IntermediateDirectory)/.d:
@test -d ./Debug || $(MakeDirCommand) ./Debug
PreBuild:
@echo Executing Pre Build commands ...
$(eval gsl_flags = -L/opt/local/lib -lgsl -lgslcblas -lm -I/opt/local/include -DHAVE_INLINE)
$(eval commonflags := -Wall -Wextra -std=c99 -pedantic -Wno-unknown-pragmas -Wshadow -Wpointer-arith)
$(eval commonflags += $(CFLAGS))
$(eval commonflags += -g -DEEMD_DEBUG=0)
$(eval commonflags += -DCLANG)
$(eval PREFIX ?= /usr)
@echo Done
# all
Debug/main.c.o: main.c
#src/eemd.h | Debug
clang $(commonflags) -c $< $(gsl_flags) -o $@
Debug/main.c.a: Debug/main.c.o
$(AR) rcs $@ $^
eemd: main.c src/eemd.h
clang $(commonflags) $< -fPIC -shared -Wl, ,$@ $(gsl_flags) -o $@
Мои извинения за длину этого поста. В прошлом я запускал только неизмененные файлы make, а не их отладку. Итак, многое из этого является новым и не прозрачным для меня. Буду признателен за любую помощь.