Как отобразить имена строк и столбцов в biclust heatmap?

Question

Я нарисовал карту тепла в пакете biclust, используя следующий код, но я не смог найти никакой опции для добавления имен строк и столбцов.

library(biclust)
set.seed(1234)
data(BicatYeast)
resplaid <- biclust(BicatYeast, BCBimax(), verbose = FALSE)
heatmapBC(x = BicatYeast, bicResult = resplaid)

Как я могу их нарисовать?

Answer 1

Вот решение. Глядя на функцию heatmapBC, вы видите, что оси по умолчанию установлены в FALSE! Вы сможете разместить свои метки как в строках, так и в столбцах вашей тепловой карты, используя команду оси. Я использовал подмножественную версию данных BicatYeast, чтобы сделать графики более четкими

 library(biclust)
 set.seed(1234)
 data(BicatYeast)
 d <- as.matrix(BicatYeast)[1:30, 1:20]; d
 resplaid <- biclust(d, BCBimax())
 par(mar=c(10, 6, 2, 2) + 0.1)
 heatmapBC(x = d, bicResult = resplaid, axes = F, xlab = "", ylab = "")
 axis(1, at=1:dim(d)[2], labels = colnames(d), las=2)
 axis(2, at=1:dim(d)[1], labels = rownames(d), las=2)