попробуйте поместить это в свой блок сервера:
location ~/ThirdPartySoftware.php {
root $MAGE_ROOT;
fastcgi_pass fastcgi_backend;
fastcgi_index ThirdPartySoftware.php;
fastcgi_param SCRIPT_FILENAME $document_root$fastcgi_script_name;
fastcgi_param PATH_INFO $fastcgi_path_info;
include fastcgi_params;
}
Похоже, что вы отказываете во всем php-доступе, кроме тех, которые явно объявлены на месте. Поэтому я думаю, что если этот конфиг работает для вас, вам просто нужно относиться к вашей проблеме, как к обновлению или блоку основного расположения приложения.