Насколько я знаю, у вас нет никакого контроля над версией сгенерированного PWA APK, и version не является поддерживаемым атрибутом . Там не будет никакого смысла, потому что APK не упаковывает код вашего приложения, он просто загружает ресурсы из Интернета.
Вы контролируете, какую версию PWA используют ваши пользователи, развертывая новую версию сайта и следя за тем, чтобы все работники службы, которые у вас есть, обновляли все кэшированные ресурсы.