Application.Run
будет запускать любую функцию с совпадающим именем, определенным в обычном модуле, в любой открытой книге в приложении Excel, включая открытые надстройки Excel. Вы можете добавить префикс имени функции к имени рабочей книги и восклицательному знаку, чтобы сузить поиск до конкретной рабочей книги, и вы можете передать необходимые параметры, например,
Application.Run("AddinWorkbookName.xlam!FunctionName", Parameter1, Parameter2)
Очевидно, вам необходимо убедиться, что рабочая книга (или надстройка), к которой вы обращаетесь, открыта в Excel. Вы можете увидеть список всех открытых рабочих книг в Project Explorer в VBE.