Вы можете просто пройтись по своему dict
(да, это словарь, а не `список), и напечатать первый элемент,
x = {'5ogb.pdb': [[['ASN', 15.0, 'A'], 8.0], [['ASN', 26.0, 'A'], 12.0]]}
for list_object in x['5ogb.pdb']:
print(list_object[0])
# output,
['ASN', 15.0, 'A']
['ASN', 26.0, 'A']