Если я вас правильно понял, речь идет о переходной зависимости для Y.jar через X.jar к чему-то, называемому "abc", версия 1 вместо версии 2.
Если это так, просто поместите прямую зависимость от "abc" версии 1 в Y.jar, и Maven переопределит / пропустит транзитивную зависимость из X.jar
Если вы получите что-то о конфликте между ними, вы можете добавить <exclude>
для «abc» версии 2 в зависимость для X.jar в Y.jar pom - просто чтобы быть уверенным, что «abc» версия 2 никогда не придет к фотография с X.jar pom.