У меня есть изображения с несколькими типами клеток, показывающие двухслойную клеточную стенку, и я хотел бы оценить общую площадь каждой клетки (размер клетки) и оценить площадь без клеточных стенок (просвет). Клетки разделяют внешнюю клеточную стенку ( необработанное изображение 16 бит ).
Из порогового шага я получил бинарное изображение со стенками клеток (снаружи и внутри, пороговое изображение ), но из-за специфической анатомии этих клеточных стенок, доступны плагины (обычно разработанные для флуоресцентных изображений ) не работал так же хорошо, как обычно этапы сегментации или скелетонизации.
Сейчас я пытаюсь разработать свой собственный макрос, но я заблокирован. Когда я выбираю внешнюю структуру клеточной стенки, мне не удается преобразовать выделение в многоугольник или полилинию. У вас есть несколько советов для этого?
Во-вторых, как я могу обозначить ограниченную внутренней стенкой ячейки часть объекта, ограниченной внешней стенкой? (Я не знаю, если вопрос ясен)
Спасибо.