К сожалению, кажется , что это поведение нельзя изменить.
Если вы хотите, чтобы разметка вашей страницы содержала правильную разметку для создания экземпляра и регистрации вашего пользовательского элемента управления, вы должны перетащить ее в представление конструктора, а не в представление исходного кода.
Чтобы сделать это немного проще, вы можете использовать разделенное представление в Visual Studio 2008, которое, по крайней мере, позволит вам одновременно иметь оба «представления» без необходимости «переключаться» между ними.