Фоновый цвет указывает на коммиты, которые включены в текущую ветку (ту, которая была проверена в данный момент). Белый фон показывает коммиты, которых нет в текущей ветке.
Поскольку вы слились с A, A должна быть вашей текущей ветвью (если не использовалось какое-то конкретное слияние - fast-forward), а коммиты с нее не должны иметь белого фона.
Снимок экрана, однако, не дает четкого представления о том, где находится ветвь A, где находится ветвь B и какая ветвь в настоящее время извлечена.
объединены B в филиал A в 31.03.2017 17:00
На скриншоте нет такого коммита слияния. Может быть, журнал не обновляется должным образом?