Просто начинайте работу с Windows 10 IoT Core на Raspberry Pi 3.
Мне не очевидно, как просто загружаться в Windows, а не загружаться в приложение (например, defaultapp). Может быть, это не возможно? Я бы ожидал такого типа конфигурации с микроконтроллером, как Arduino, но ожидал командную оболочку или PowerShell при загрузке Windows на Pi. Я не обязательно ожидал графический интерфейс или рабочий стол.
Командная строка в приложении по умолчанию на самом деле не похожа на командную строку. И я не вижу выхода из приложения по умолчанию.