Терминал в PyCharm все еще является системным терминалом.
Таким образом, вы должны добавить свой путь python binarys в системную переменную окружения PATH.
Или вы можете использовать опцию «Переменные среды» внутри settings / tools / Terminal и добавить туда новую запись, например PATH = $ PATH $; <Путь к вашему двоичному файлу python>
Затем python должен запуститься в окне терминала PyCharms.
Но для доступа к вашей виртуальной среде вам все равно нужно запустить ее, как в обычном терминале: venv \ Scripts \ activate (в Windows).