У меня есть код, в котором я устанавливаю переменную в файл
x <- file.choose()
pathtofile <- dirname(dirname(x))
print(pathtofile)
"/Volumes/Lab/Darwin/Patient6/Cells"
Есть ли способ написать (pathtofile) на терминал, как это?
cd ~/Desktop
pwd
perl ~/Desktop/Scripts/perlscript.pl [pathtofile/txtfile.txt]
Мне также было интересно, есть ли в Rmarkdown команда, которая могла бы автоматически взять блок выполнения и вывести его на терминал вместо консоли. Я знаю ярлык cmd + alt + enter для mac, но мне бы хотелось, чтобы он был автоматизирован и соединял его с предыдущим чанком, который запускается на консоли, чтобы они запускались в одном чанке, как работает Rmarkdown.
```{terminal}
cd ~/Desktop
pwd
```
Нечто подобное выше, где он вывел бы Desktop как pwd