Установить в config.php
$config['index_page'] = '';
Тогда ваш .htaccess You RewriteBase
может выглядеть как показано ниже в зависимости от вашей корневой папки или просто /
, если приложение работает в корневой папке
<IfModule mod_rewrite.c>
RewriteEngine On
RewriteBase /folder_name/
RewriteCond $1 !^(index\.php|images|robots\.txt)
#Removes access to the system folder by users.
RewriteCond %{REQUEST_URI} ^system.*
RewriteRule ^(.*)$ /index.php/$1 [L]
#This snippet prevents user access to the application folder
RewriteCond %{REQUEST_URI} ^application.*
RewriteRule ^(.*)$ /index.php/$1 [L]
#Checks to see if the user is attempting to access a valid file,
#such as an image or css document, if this isn't true it sends the
#request to index.php
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule ^(.*)$ index.php/$1 [L]
</IfModule>
<IfModule !mod_rewrite.c>
ErrorDocument 404 /index.php
</IfModule>