В awk
ниже я пытаюсь выполнить синтаксический анализ $2
, используя _
, только если $3
является определенным значением (ID). Я читаю это проанализированное значение в массив и собираюсь использовать его в качестве ключа в поиске. awk
выполняется, но вся строка 2 или строка с ID
в $3
печатает не только желаемое. Оператор печати предназначен только для того, чтобы увидеть, какие результаты (только для тестирования) и не будет частью сценария. Спасибо:).
AWK
awk -F'\t' '$3=="ID"
f="$(echo $2|cut -d_ -f1,1)"
{
print $f
}' file
файл tab-delimited
R_Index locus type
17 chr20:31022959 NON
18 chr11:118353210-chr9:20354877_KMT2A-MLLT3.K8M9 ID
желательно
$f = chr11:118353210-chr9:20354877