Есть несколько хороших постов / ответов на эту тему. Ниже объясняется, как вы можете столкнуться с проблемами при определении пространства имен в верхней части файла: https://stackoverflow.com/a/151560/1617161
Вот еще одно обсуждение потенциальных проблем: https://stackoverflow.com/a/1342873/1617161
Я всегда размещал их в верхней части файла, что кажется безопасным, если ваши пространства имен и классы сильно зависят от приложения; то есть. Не будет конфликтовать с другими Dll.
Я полагаю, что это специфично для Entity Framework, и они пытаются предотвратить конфликты с классами в пространстве имен System.Data.Entity.Migrations. Размещение внутри пространства имен уменьшает вероятность взлома чьего-либо кода, класс которого имеет то же имя, что и класс в пространстве имен System.Data.Entity.Migrations.