Вы действительно можете сделать свойство обратным самому себе, это нормально. Однако более явным способом выражения того, что отношение является двунаправленным, является определение свойства симметричный :
<owl:SymmetricProperty rdf:about="http://www.co-ode.org/ontologies/ont.owl#isLinkedTo"/>