Я не верю, что есть способ сделать это. Однако вы можете реализовать интерфейс в своей модели, расширив сгенерированную доктриной модель и реализовав интерфейс в подклассе. По моему мнению, при выполнении этого дополнительного шага не теряется никакой ценности, потому что, как только вы объявляете, что реализуете интерфейс, вам фактически нужно ввести код, чтобы сделать это.
Вам лучше реализовать интерфейс в подклассе сгенерированного класса, чтобы при повторной генерации класса ни одно из ваших изменений не потерялось.