динамически создавая переменную внутри функции оптимизации scipy - PullRequest
0 голосов
/ 31 августа 2018

Приведенный ниже код предназначен для нахождения минимальных ошибок в приближении тензора с тремя матрицами a, b, c. Оптимизация осуществляется с помощью переменных a, b, c.

Я новичок в деле оптимизации, поэтому, пожалуйста, помогите мне понять это. Мои запросы:

  1. внутри f, как мы можем использовать значения a, b, c на каждой итерации.
  2. Как мы можем создать переменную для khatri_rao продукта, используя a, b, c для каждой итерации.
  3. Для каждой итерации значения params[0]/[1]/[2] не являются значениями двумерного массива. Даже начальные значения не видны? Ошибка моего кода говорит о том, какой кортеж?

Любая помощь приветствуется. Спасибо

import scipy.optimize as optimize
import numpy as np
import sys
sys.path.append("../tensorly-master/")
import tensorly as tl

def f(params, t0, t1, t2):#arguments are tensor unfold
    a, b, c= params[0], params[1], params[2]#multi variables in optimization
    #norm of tensor unfold mode0 minus "a" matrix multiplied with transpose of ' khatri rao product of "c" & "b" '
    value0= t0 - np.matmul(a, tl.tenalg.khatri_rao([c, b], reverse=False).T)
    value1= t1 - np.matmul(b, tl.tenalg.khatri_rao([a, c], reverse=False).T)
    value2= t2 - np.matmul(c, tl.tenalg.khatri_rao([b, a], reverse=False).T)
    #sum of all norms
    values=np.linalg.norm(value0, "fro")+np.linalg.norm(value1, "fro")+np.linalg.norm(value2, "fro")
    #optimizing the sum of all norms be minimum
    return values

#randomly initialinzing tensor , three arrays and unfolding tensor
tn=np.random.uniform(low=0, high=100, size=(3,3,3))
a=np.random.uniform(low=0, high=100, size=(3,2))
b=np.random.uniform(low=0, high=100, size=(3,2))
c=np.random.uniform(low=0, high=100, size=(3,2))
t0=tl.unfold(tn, 0)
t1=tl.unfold(tn, 1)
t2=tl.unfold(tn, 2)
#optimization
result=optimize.minimize(f, [a, b, c], args=(t0, t1, t2))
if result.success:
    fitted_params = result.x
    print(fitted_params)
else:
    raise ValueError(result.message)

ошибка:

error:-
Using numpy backend.
Traceback (most recent call last):
  File "stc.py", line 27, in <module>
    result=optimize.minimize(f, [a, b, c], args=(t0, t1, t2))
  File "/home/manish/.local/lib/python2.7/site-packages/scipy/optimize/_minimize.py", line 597, in minimize
    return _minimize_bfgs(fun, x0, args, jac, callback, **options)
  File "/home/manish/.local/lib/python2.7/site-packages/scipy/optimize/optimize.py", line 963, in _minimize_bfgs
    gfk = myfprime(x0)
  File "/home/manish/.local/lib/python2.7/site-packages/scipy/optimize/optimize.py", line 293, in function_wrapper
    return function(*(wrapper_args + args))
  File "/home/manish/.local/lib/python2.7/site-packages/scipy/optimize/optimize.py", line 723, in approx_fprime
    return _approx_fprime_helper(xk, f, epsilon, args=args)
  File "/home/manish/.local/lib/python2.7/site-packages/scipy/optimize/optimize.py", line 657, in _approx_fprime_helper
    f0 = f(*((xk,) + args))
  File "/home/manish/.local/lib/python2.7/site-packages/scipy/optimize/optimize.py", line 293, in function_wrapper
    return function(*(wrapper_args + args))
  File "stc.py", line 10, in f
    value0= t0 - np.matmul(a, tl.tenalg.khatri_rao([c, b], reverse=False).T)
  File "../tensorly-master/tensorly/tenalg/_khatri_rao.py", line 70, in khatri_rao
    n_columns = matrices[0].shape[1]
IndexError: tuple index out of range

1 Ответ

0 голосов
/ 01 сентября 2018

optimize вызывает функцию f, передавая одномерный массив (shape (n,)), даже если данное первоначальное предположение не является этой формой (см., Например, в _minimize_bfgs) , Вы можете использовать reshape и numpy.split для восстановления правильных двумерных массивов a, b и c из массива 1D params:

import scipy.optimize as optimize
import numpy as np
import tensorly as tl

def f(params, t0, t1, t2): # arguments are tensor unfold
    a, b, c = np.split(x0.reshape(3, 6), 3, axis=1)  # unpack the variables

    # norm of tensor unfold mode0 minus "a" matrix 
    # multiplied with transpose of ' khatri rao product of "c" & "b" '
    value0= t0 - np.matmul(a, tl.tenalg.khatri_rao([c, b], reverse=False).T)
    value1= t1 - np.matmul(b, tl.tenalg.khatri_rao([a, c], reverse=False).T)
    value2= t2 - np.matmul(c, tl.tenalg.khatri_rao([b, a], reverse=False).T)
    #sum of all norms
    values = np.linalg.norm(value0, "fro") + \
             np.linalg.norm(value1, "fro") + \
             np.linalg.norm(value2, "fro")

    # optimizing the sum of all norms be minimum
    return values

# randomly initializing tensor, three arrays and unfolding tensor
tn = np.random.uniform(low=0, high=100, size=(3,3,3))
t0 = tl.unfold(tn, 0)
t1 = tl.unfold(tn, 1)
t2 = tl.unfold(tn, 2)

# Initial guess :
a = np.random.uniform(low=0, high=100, size=(3,2))
b = np.random.uniform(low=0, high=100, size=(3,2))
c = np.random.uniform(low=0, high=100, size=(3,2))

x0 = np.hstack([a, b, c]).ravel()

# optimization
result = optimize.minimize(f, x0, args=(t0, t1, t2))

if result.success:
    fitted_params = result.x
    print(fitted_params)
else:
    raise ValueError(result.message)
...