Я так не думаю. Разрешения кода могут быть установлены только через конфигурацию приложения, и даже если это можно сделать с помощью кода, то для кода, который их устанавливает, также потребуется разрешение для этого. Даже тогда настройки из web.config или machine.config будут иметь приоритет.
Смысл этих разрешений кода в том, что администраторы могут контролировать, что может делать приложение. Если AppDommain для вашего приложения не имеет прав на определенные действия, почему и у ActiveX, который вы создаете, они есть?