Я занимаюсь НЛП исследованиями некоторых клинических документов, используя cTAKES, и я немного застрял в какой-то момент.
Я создал конвейер, похожий на AggregateCdaUMLSProcessor.xml, в котором я хочу использовать dictionary_lookup UmlsLookupAnnotator.xml вместо DictionaryLookupAnnotatorUmls.xml.
identifiedAnnotations, данное UmlsLookupAnnotator, не включает Sign/Symptoms, Disease/Disorder или Procedure Mentions и т. Д. Я сделал требуемый sofaMapping в Java. Конвейер работает нормально для открытого текста, но не дает вышеупомянутые аннотации для CDA Я проверил документ CDA, используя AggregateCdaUMLSProcessor, и он дает вышеупомянутые аннотации (кроме MedicationMention, который мне также нужен).
Было бы очень полезно, если бы кто-нибудь мог дать мне какое-либо предложение о том, что я могу попробовать или что не так?
С нетерпением жду ответа от вас.