Это связано со строкой 126 в facebox.js:
осталось: 385,5
Это происходит в функции загрузки.
Как видите, позиция лицевой коробки жестко закодирована.
Я исправил это в моем случае, изменив эту строку на:
слева: $ (окно) .width () / 2 - (490/2)
(ПРИМЕЧАНИЕ: измените 490 из моего примера на ширину таблицы #facebox)