У меня та же проблема:
Шаблон:
<textarea id="pagination" style="display:none"><b>pagination</b></textarea>
Если я назову шаблон как:
$('').setTemplate($('pagination').html(),[],{filter_data: false});
$('').processTemplate();
Это не работает. его отображение как:
<b>pagination</b>
Если я вызываю тот же шаблон с помощью setTemplateElement, например:
$('').setTemplateElement('pagination');
$('').processTemplate();
Это работает. его отображение как: нумерация страниц