Повторное использование блока кода для pandoc и R в одном и том же файле Rmd - PullRequest
Новая
       7

Повторное использование блока кода для pandoc и R в одном и том же файле Rmd

0 голосов
/ 10 января 2019

Я написал следующий файл RMarkdown для отображения кода, используемого с правильной нумерацией и переносом строк, и для отображения вывода кода на основе ответа Климента на этот вопрос ( pandoc не текст обернуть блоки кода при конвертации в pdf ): 

---
title: "Reuse code chunk"
output:
  pdf_document: 
    keep_tex: true
  html_notebook: default
editor_options:
  chunk_output_type: inline
header-includes:
  - \usepackage[T1]{fontenc}
  - \usepackage{times}
  - \usepackage{float}
  - \usepackage{booktabs}
  - \usepackage{fvextra} # https://stackoverflow.com/questions/20788464/pandoc-doesnt-text-wrap-code-blocks-when-converting-to-pdf
  - \DefineVerbatimEnvironment{Highlighting}{Verbatim}{breaklines,commandchars=\\\{\}}
---

```{r setup, include=TRUE, message=FALSE}
library(knitr)
library(dplyr)
```

<!-- https://stackoverflow.com/questions/22329685/how-to-display-line-numbers-in-rmarkdown-html-and-pdf/25299194#25299194 -->
```{#code_section .R .numberLines}  
data(iris) 

# Lorem ipsum dolor sit amet, consectetuer adipiscing elit. Aenean commodo ligula eget dolor. Aenean massa. Cum sociis natoque penatibus et magnis dis parturient montes, nascetur ridiculus mus. Donec quam felis, ultricies nec, pellentesque eu, pretium quis, sem. Nulla consequat massa quis enim. Donec pede justo, fringilla vel, aliquet nec, vulputate eget, arcu. In enim justo, rhoncus ut, imperdiet a, venenatis vitae, justo. Nullam dictum felis eu pede mollis pretium. Integer tincidunt. Cras dapibus. Vivamus elementum semper nisi. Aenean vulputate eleifend tellus. Aenean leo ligula, porttitor eu, consequat vitae, eleifend ac, enim. Aliquam lorem ante, dapibus in, viverra quis, feugiat a, tellus. Phasellus viverra nulla ut metus varius laoreet. Quisque rutrum. Aenean imperdiet. Etiam ultricies nisi vel augue. Curabitur ullamcorper ultricies nisi. Nam eget dui. Etiam rhoncus. Maecenas tempus, tellus eget condimentum rhoncus, sem quam semper libero, sit amet adipiscing sem neque sed ipsum. Nam quam nunc, blandit vel, luctus pulvinar, hendrerit id, lorem. Maecenas nec odio et ante tincidunt tempus. Donec vitae sapien ut libero venenatis faucibus. Nullam quis ante. Etiam sit amet orci eget eros faucibus tincidunt. Duis leo. Sed fringilla mauris sit amet nibh. Donec sodales sagittis magna. Sed consequat, leo eget bibendum sodales, augue velit cursus nunc,
```

```{r code_section, echo=FALSE}
data(iris) 
iris %>%
  head %>%
  kable(.,format = 'latex',booktabs=TRUE,linesep='')

# Lorem ipsum dolor sit amet, consectetuer adipiscing elit. Aenean commodo ligula eget dolor. Aenean massa. Cum sociis natoque penatibus et magnis dis parturient montes, nascetur ridiculus mus. Donec quam felis, ultricies nec, pellentesque eu, pretium quis, sem. Nulla consequat massa quis enim. Donec pede justo, fringilla vel, aliquet nec, vulputate eget, arcu. In enim justo, rhoncus ut, imperdiet a, venenatis vitae, justo. Nullam dictum felis eu pede mollis pretium. Integer tincidunt. Cras dapibus. Vivamus elementum semper nisi. Aenean vulputate eleifend tellus. Aenean leo ligula, porttitor eu, consequat vitae, eleifend ac, enim. Aliquam lorem ante, dapibus in, viverra quis, feugiat a, tellus. Phasellus viverra nulla ut metus varius laoreet. Quisque rutrum. Aenean imperdiet. Etiam ultricies nisi vel augue. Curabitur ullamcorper ultricies nisi. Nam eget dui. Etiam rhoncus. Maecenas tempus, tellus eget condimentum rhoncus, sem quam semper libero, sit amet adipiscing sem neque sed ipsum. Nam quam nunc, blandit vel, luctus pulvinar, hendrerit id, lorem. Maecenas nec odio et ante tincidunt tempus. Donec vitae sapien ut libero venenatis faucibus. Nullam quis ante. Etiam sit amet orci eget eros faucibus tincidunt. Duis leo. Sed fringilla mauris sit amet nibh. Donec sodales sagittis magna. Sed consequat, leo eget bibendum sodales, augue velit cursus nunc,
```

Вы можете видеть, что один и тот же фрагмент повторяется как в блоке pandoc, так и в фрагменте кода R, который, как мне кажется, повторный фрагмент вручную, является довольно неэффективным, могу ли я как-то повторно использовать фрагмент кода в R / pandoc, а затем использовать его снова (в pandoc и R соответственно).

Спасибо!

1 Ответ

0 голосов
/ 15 января 2019

Я предлагаю использовать knitr хук для исходного кода (см. https://yihui.name/knitr/hooks/), который возвращает желаемую строку уценки. 

---
title: "Reuse code chunk"
output:
  pdf_document: 
    keep_tex: true
  html_notebook: default
editor_options:
  chunk_output_type: inline
header-includes:
  - \usepackage[T1]{fontenc}
  - \usepackage{times}
  - \usepackage{float}
  - \usepackage{booktabs}
  - \usepackage{fvextra} # https://stackoverflow.com/questions/20788464/pandoc-doesnt-text-wrap-code-blocks-when-converting-to-pdf
  - \DefineVerbatimEnvironment{Highlighting}{Verbatim}{breaklines,commandchars=\\\{\}}
---

```{r setup, echo=FALSE}
knitr::knit_hooks$set(source = function(x, options) {
  paste(
    collapse = '\n',
    c(
      sprintf('\n\n```{#%s .%s .numberLines}', options$label, options$engine), 
      x, 
      '```\n\n'
    )
  )
})
```

```{r pkgs, include=TRUE, message=FALSE}
library(knitr)
library(dplyr)
```

```{r code_section}
data(iris) 
iris %>%
  head %>%
  kable(.,format = 'latex',booktabs=TRUE,linesep='')

# Lorem ipsum dolor sit amet, consectetuer adipiscing elit. Aenean commodo ligula eget dolor. Aenean massa. Cum sociis natoque penatibus et magnis dis parturient montes, nascetur ridiculus mus. Donec quam felis, ultricies nec, pellentesque eu, pretium quis, sem. Nulla consequat massa quis enim. Donec pede justo, fringilla vel, aliquet nec, vulputate eget, arcu. In enim justo, rhoncus ut, imperdiet a, venenatis vitae, justo. Nullam dictum felis eu pede mollis pretium. Integer tincidunt. Cras dapibus. Vivamus elementum semper nisi. Aenean vulputate eleifend tellus. Aenean leo ligula, porttitor eu, consequat vitae, eleifend ac, enim. Aliquam lorem ante, dapibus in, viverra quis, feugiat a, tellus. Phasellus viverra nulla ut metus varius laoreet. Quisque rutrum. Aenean imperdiet. Etiam ultricies nisi vel augue. Curabitur ullamcorper ultricies nisi. Nam eget dui. Etiam rhoncus. Maecenas tempus, tellus eget condimentum rhoncus, sem quam semper libero, sit amet adipiscing sem neque sed ipsum. Nam quam nunc, blandit vel, luctus pulvinar, hendrerit id, lorem. Maecenas nec odio et ante tincidunt tempus. Donec vitae sapien ut libero venenatis faucibus. Nullam quis ante. Etiam sit amet orci eget eros faucibus tincidunt. Duis leo. Sed fringilla mauris sit amet nibh. Donec sodales sagittis magna. Sed consequat, leo eget bibendum sodales, augue velit cursus nunc,
```
...