Сегмент окрашенных клеток из цифровых изображений патологии с использованием Matlab - PullRequest
Новая
       56

Сегмент окрашенных клеток из цифровых изображений патологии с использованием Matlab

0 голосов
/ 10 января 2019

Я пытаюсь сегментировать цветные ячейки из исходных изображений, например:

enter image description here

Ячейки синего цвета - это цели, которые я хочу выделить и подсчитать.

Вот код, который я использую: 

global ButtonDown

img=imread('Zoom.png');
hsv=rgb2hsv(img);
s=hsv(:,:,2);
bw = imbinarize(s,graythresh(s));
figure

imshow(bw)
se=strel('disk',5);
bw2=imclose(bw,se);
bw3=bwareaopen(bw2,200);
figure
imshow(bw3);

D=-bwdist(~bw3);
mask=imextendedmin(D,2);
D2=imimposemin(D,mask);
Ld=watershed(D);
Water_splited=bw3;
Water_splited(Ld==0)=0;
%axes(handles.axes1);
show_img=Water_splited;
figure
imshow(show_img)


if ButtonDown == 1
 pos = get(handles.axes1, 'CurrentPoint');
 row=floor(pos(1,2));
 col=floor(pos(1,1));
 Diy_splited=show_img;
 Diy_splited(row,col)=0;
 show_img=Diy_splited;
 axes(handles.axes1);
 imshow(show_img);
end

Я использовал алгоритм водораздела для сегментирования прилипших клеток, однако произошла избыточная сегментация.
Результаты:

enter image description here

Так, как избежать этой проблемы чрезмерной сегментации?

...