В вашем вызове SQL вы можете назначить псевдоним вашему столбцу, например:
SELECT id_user AS id FROM users_table
В качестве альтернативы ваш распознаватель может взять результат запроса и переименовать поле.
Я бы сделал это, только если вы используете что-то вроде MongoDB, где вы не можете назначить псевдонимы столбцам.
Если вы хотите сделать это в GraphQL, то вам придется сделать это на стороне клиента, назначив псевдоним полю:
user {
id: id_user
}