Если вы уверены, что фон кнопки имеет цвет, а не какой-либо другой рисунок, то:
button.setOnClickListener {
button.setBackgroundColor(if ((button.background as ColorDrawable).color == Color.RED) Color.GREEN else Color.RED)
}
измените button
на идентификатор ваших Button
и Color.GREEN
и Color.RED
на нужные вам цвета.